《女子学校通缉令》告诉了警察局著名的不幸兄弟“老鼠”和“键盘”的故事，他们总是得不到学分，投诉成堆。他们两个对彼此都不满意，都专注于改变这个不幸的伴侣。导演承诺，如果他们成功破案，他们将考虑更换伴侣的请求，因此两人自愿在一所贵族女子学校担任卧底特工，调查一起“面膜上瘾”案件。在联系人Boos Yang的支持下，尽管他们不断挣扎，但他们也通过自己的女装获得了很多便利，并逐渐找到了线索。与此同时，令两个倒霉的兄弟感到惊讶的是，这所学校还发生了一起隐蔽的武器走私案。在卧底调查过程中，两人摒弃偏见，开始认真追查线索